Au cours des dernières années la FIBA a vu évoluer de façon positive le niveau de son implication dans les programmes de conservation de la nature et d'appui au développement durable en Afrique de l'Ouest. Ses statuts ont été modifiés en 2002 et elle contribue aujourd'hui à la mise en œuvre du Programme Régional de Conservation de la zone Côtière et marine en Afrique de L'Ouest, le PRCM, en collaboration étroite avec l'UICN, le WWF, Wetlands International, la Commission Sous-Régionale des Pêches (CSRP) et le Réseau Régional de Planification Côtière. Les pays concernés par ce programme sont, la Mauritanie, le Sénégal, la Gambie, la Guinée-Bissau, la Guinée et le Cap-vert.
La FIBA a pour mission d’appuyer la conservation, la valorisation et la promotion du Banc d’Arguin et des autres écosystèmes littoraux critiques d’Afrique de l’ouest pour un développement harmonieux et durable.
La FIBA porte la vision suivante « Un environnement côtier ouest africain sain et productif, au bénéfice des sociétés humaines ».